Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP43Q70EL4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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