Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYDE1Q6ZW31 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms