Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC73Q6ZRK6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC73Q6ZRK6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms