Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms