Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00114Q6XXX2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00114Q6XXX2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00114Q6XXX2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00114Q6XXX2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00114Q6XXX2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms