Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSTM1Q6UX27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM1Q6UX27 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms