Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L9Q6RFH8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms