Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q6P435 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q6P435 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q6P435 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6P435 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms