Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H3F3CQ6NXT2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms