Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF544Q6NX49 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms