Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms