Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TYW3Q6IPR3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms