Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL2Q6F5E8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms