Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms