Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USPL1Q5W0Q7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms