Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q5VSD8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms