Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BEND3Q5T5X7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BEND3Q5T5X7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms