Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CELF3Q5SZQ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF3Q5SZQ8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms