Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms