Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPAT3Q53EU6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPAT3Q53EU6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms