Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM259Q4ZIN3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms