Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC142Q17RM4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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