Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NTRK2Q16620 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NTRK2Q16620 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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