Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CARTPTQ16568 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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