Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABRA6Q16445 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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