Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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