Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMA4Q16363 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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