Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNGA3Q16281 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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