Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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