Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RYR3Q15413 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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