Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF6Q15052 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGEF6Q15052 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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