Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1D2Q14995 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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NR1D2Q14995 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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