Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GINS1Q14691 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GINS1Q14691 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms