Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF1Q14162 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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