Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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ITGA9Q13797 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA9Q13797 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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