Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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