Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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