Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
STRN3Q13033 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms