Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIK3Q13003 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIK3Q13003 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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