Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXF1Q12946 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXF1Q12946 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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