Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
STX4Q12846 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
STX4Q12846 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
STX4Q12846 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
STX4Q12846 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
STX4Q12846 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
STX4Q12846 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
STX4Q12846 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms