Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms