Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms