Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EP300Q09472 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EP300Q09472 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EP300Q09472 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EP300Q09472 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EP300Q09472 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EP300Q09472 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EP300Q09472 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EP300Q09472 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms