Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNA1Q09470 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNA1Q09470 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms