Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP4Q09028 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms