Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C2orf54Q08AI8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms