Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC1Q08554 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms