Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LGALS3BPQ08380 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms