Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LRP1Q07954 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms